扬州大学药学专业隶属于医学院药学系。2001年开始招生，学制四年，授予理学学士学位，专业代码为：100701。

本专业贯彻“强基础，重素质，求创新，促发展”的理念，立足于培养具备药学领域基本理论、基本知识和实验技能，能够从事药物临床应用、药物生产、药物质量控制、药物研究与开发、药物营销和药物监督管理等方面工作的高素质复合型专门人才。

为保证人才培养质量，本专业依托江苏省一级重点学科、国家中医药管理局重点研究室、扬州大学一级重点学科及省级重点实验室和创新团队开展相关的理论和实践教学。为了满足不同学生就业要求，本专业还开设了临床药学辅修课程，以满足毕业后从事临床药师的学生的需求。专业授课教师队伍中，具有博士学位者占比81.5%，其中，有海外经历者占50%。药学、中药学两个一级学科硕士点和中药学一级专业硕士点、六个研究生工作站、二所附属医院、四个药业集团和一个药品检验所为本专业学生实践教学基地。近年来，药学专业本科就业率均为100%。

核心课程包括：高等数学、医用物理学、有机化学、无机化学、分析化学、色谱与光谱分析、物理化学、人体解剖学、生理学、生物化学与分子生物学、微生物学、免疫学基础、药物化学、天然药物化学、药理学、药物分析、药剂学、生药学、药用植物学、药物治疗学、中药学、药物动力学、药事管理与法规。其中，药理学为“江苏省精品资源共享课程”，具有生化活性的纳米材料-纳米酶的研究为本专业的特色发展方向。