扬州大学医学部团委认真贯彻落实习近平新时代中国特色社会主义思想，坚持立德树人，秉承“厚德惠生、博极医源”育人理念，以“做青年身边的共青团”为目标，通过主题教育、科技创新、志愿服务、社会实践等主题项目构建“凝聚青年、服务大局、当好桥梁、从严治团”四维工作格局，着力保持和增强政治性、先进性、群众性，提升组织力、引领力、服务力，扎实推进共青团的各项工作和建设。2016年被团省委确定为第十八批“江苏省五四红旗团委创建单位”，2018年获评“江苏省五四红旗团委”，2020年获评“全国五四红旗团委”。