成人学历教育方面，我院目前设有临床医学专升本（业余）、中西医临床医学专升本（业余）、医学检验技术专升本（业余）、药学等专升本（函授）、药学高起本（函授）等5个本科专业。其中，临床医学专业为成人高等教育省重点专业，药学为校特色专业，有外科学、病源生物与免疫学、人体解剖学、药理学、生物化学与分子生物学等5门省级成教精品资源共享课程，病理学、药理学、预防医学、内科学、妇产科学、皮肤性病学、中医基础综合、外科护理学等9门校成教精品课程。学院主编出版了18门课程具有成人教育特色的教材，所有课程的课堂教学均开展网络同步直播。目前在籍专升本及高起本学历教育成教学生3000多人。

成人非学历继续教育方面,我院充分发挥有多个医学专业和综合大学学科齐全、并有多个临床教学附属医院的优势，注重资源整合、行业配合，将医药、心理、戒毒三大块具有专业优势的培训项目做出了特色，做成了品牌，现为中国司法行政戒毒医疗培训基地，司法部心理咨询师培训基地。基地先后培训来自全国的戒毒人民警察5000多名，心理咨询师及心理咨询师督导培训全国司法系统干警9000多名。

在医药培训方面，把基层医疗队伍建设放在首位，我院先后为本地基层医疗卫生等单位培训5000多人。面向、卫生、民政养老及综治等系统开设有全科医生、急诊急救、病理科医技、妇产科医护、助产技术、西医学中医、基层口腔、社区检验、社区X线、社区B超、社区药学、合理用药、校医与保健教师、营养配餐、保健老师、中药调剂员、养老护理等20多个培训项目。

面向教育系统，我院是教育部全国职教师资培训基地，承办了全国中等职业学校专业骨干教师农村医学、药剂学、中医学、护理学等专业的国培任务，培训学员五届，获得学员普遍好评。是江苏省健康教师培训项目承担单位，先后培训全生命健康教师700多人。从2011年起，我院受扬州市教育局委托，先后为扬州市教育系统教师举办了心理咨询师、心理健康教育、中小学保健教师、青少年近视防控、营养配餐师、幼儿园育婴师、幼儿保健专业证书、学校卫生保健专业证书等专业培训班近40个，培训中小学教师4200多人。学员通过学习后提升了履职能力，成为我市学校卫生保健、心理健康教育、心理咨询工作的骨干，为提高我市中小学校的健康、平安、校园稳定发挥了积极作用。